Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip4Q9QXN3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms