Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms