Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms