Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms