Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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