Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp1Q9JLK7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp1Q9JLK7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp1Q9JLK7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp1Q9JLK7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp1Q9JLK7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cabp1Q9JLK7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cabp1Q9JLK7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cabp1Q9JLK7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cabp1Q9JLK7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cabp1Q9JLK7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cabp1Q9JLK7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cabp1Q9JLK7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cabp1Q9JLK7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cabp1Q9JLK7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cabp1Q9JLK7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms