Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Tgm1Q9JLF6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgm1Q9JLF6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms