Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TefQ9JLC6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms