Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsmQ9JL96 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms