Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FancaQ9JL70 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FancaQ9JL70 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms