Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms