Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms