Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms