Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nova1Q9JKN6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nova1Q9JKN6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nova1Q9JKN6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nova1Q9JKN6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nova1Q9JKN6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nova1Q9JKN6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nova1Q9JKN6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms