Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Stx6Q9JKK1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx6Q9JKK1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms