Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms