Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ube2j1Q9JJZ4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Ube2j1Q9JJZ4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Ube2j1Q9JJZ4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Ube2j1Q9JJZ4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ube2j1Q9JJZ4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Ube2j1Q9JJZ4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ube2j1Q9JJZ4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2j1Q9JJZ4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Ube2j1Q9JJZ4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Ube2j1Q9JJZ4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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