Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx20Q9JJY4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Ddx20Q9JJY4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Ddx20Q9JJY4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Ddx20Q9JJY4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx20Q9JJY4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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