Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl3Q9JJR7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms