Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms