Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms