Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip1Q9JJ57 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms