Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1Q9JIT0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms