Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms