Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms