Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms