Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc28a3Q9ERH8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Slc28a3Q9ERH8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Slc28a3Q9ERH8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc28a3Q9ERH8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc28a3Q9ERH8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc28a3Q9ERH8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc28a3Q9ERH8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc28a3Q9ERH8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc28a3Q9ERH8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc28a3Q9ERH8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc28a3Q9ERH8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc28a3Q9ERH8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms