Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap29Q9ERB0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap29Q9ERB0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap29Q9ERB0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap29Q9ERB0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap29Q9ERB0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap29Q9ERB0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap29Q9ERB0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap29Q9ERB0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap29Q9ERB0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap29Q9ERB0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap29Q9ERB0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap29Q9ERB0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap29Q9ERB0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap29Q9ERB0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snap29Q9ERB0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snap29Q9ERB0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms