Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rapgef4Q9EQZ6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef4Q9EQZ6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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