Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR5

Lime1, Lck-interacting transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lime1Q9EQR5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lime1Q9EQR5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lime1Q9EQR5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lime1Q9EQR5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms