Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnn1Q9EQR3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnn1Q9EQR3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms