Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms