Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ51

Vmn1r47, Vomeronasal type-1 receptor 47, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r47Q9EQ51 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r47Q9EQ51 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r47Q9EQ51 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r47Q9EQ51 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r47Q9EQ51 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r47Q9EQ51 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms