Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms