Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc1Q9EP53 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc1Q9EP53 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms