Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufs3Q9DCT2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufs3Q9DCT2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms