Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop7Q9DCH2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.2 ms