Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syde1Q9DBZ9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms