Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms