Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms