Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tysnd1Q9DBA6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms