Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB96

Ngdn, Neuroguidin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgdnQ9DB96 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgdnQ9DB96 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgdnQ9DB96 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgdnQ9DB96 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgdnQ9DB96 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgdnQ9DB96 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgdnQ9DB96 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgdnQ9DB96 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgdnQ9DB96 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgdnQ9DB96 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgdnQ9DB96 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgdnQ9DB96 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NgdnQ9DB96 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgdnQ9DB96 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgdnQ9DB96 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgdnQ9DB96 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgdnQ9DB96 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NgdnQ9DB96 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgdnQ9DB96 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NgdnQ9DB96 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgdnQ9DB96 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgdnQ9DB96 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NgdnQ9DB96 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgdnQ9DB96 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms