Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms