Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd9Q9D9M4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pdzd9Q9D9M4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms