Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Usp12Q9D9M2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Usp12Q9D9M2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Usp12Q9D9M2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Usp12Q9D9M2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp12Q9D9M2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
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Usp12Q9D9M2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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