Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actrt1Q9D9J3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms