Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg7Q9D906 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg7Q9D906 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg7Q9D906 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg7Q9D906 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg7Q9D906 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg7Q9D906 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg7Q9D906 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg7Q9D906 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg7Q9D906 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atg7Q9D906 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258.4 ms