Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot8Q9D8X5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms