Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lin37Q9D8N6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lin37Q9D8N6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms