Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc52a2Q9D8F3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc52a2Q9D8F3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms